Det tekniske princip bag en trollingmotor går ud på at omdanne elektrisk energi til mekanisk tryk ved at bruge en propel til at generere en reaktiv kraft mod vandet, og derved drive et bådskrog eller et stykke udstyr fremad. Dens kernestrømkilde er en børsteløs jævnstrømsmotor; ved elektrificering får elektromagnetiske vekselvirkninger mellem motorens interne stator og rotor, at sidstnævnte roterer med høj hastighed, hvilket driver propellen og omsætter rotationsbevægelse til fremdriftskraft mod vandet.
Trollingmotorer er typisk udstyret med et elektronisk hastighedskontrolsystem (ESC), som regulerer rotationshastigheden-og dermed muliggør jævne hastighedsovergange-ved at justere strøm- og spændingsstrømmen. Brugere indtaster kommandoer via et styrehåndtag eller trådløs controller; kontrolsystemet oversætter derefter disse signaler til motoroutput for at udføre acceleration, deceleration og retningsjusteringer. Visse avancerede-modeller inkorporerer også funktioner såsom trinløs hastighedskontrol og intelligent hastighedsbegrænsning for at øge operationel præcision og sikkerhed.
Propellens blade er aerodynamisk optimeret til at generere tryk, når de roterer gennem vandet, samtidig med at kavitation og energitab minimeres. Motorens hus har typisk et strømlinet design for at reducere hydrodynamisk modstand og øge effektiviteten. Overordnet set repræsenterer driftsprincippet for en trollingmotor en synergistisk kombination af "elektromagnetisk drev", "elektronisk kontrol" og "hydrodynamisk fremdrift", der leverer stabil og højeffektiv undervandsfremdrift.

